📅 2026-08-29 · 🏷️ AI科研 · Agent Skills · 生物信息
项目概览
GitHub: K-Dense-AI/scientific-agent-skills · 语言: Python · ⭐ 37.3k+ · 163技能 / 100+科学数据库 · 17.5万科研用户
K-Dense 出品的开源科研技能库,遵循开放 Agent Skills 标准,兼容 Cursor、Claude Code、Codex、Gemini CLI、Google Antigravity 等。装上之后,你的 AI 编码代理就具备了执行复杂多步科研工作流的能力——从单细胞 RNA 测序分析到分子对接、从 PK/PD 建模到全息生物医学文献检索。
技能本质是"给代理的知识包":每个 SKILL.md 内置精选文档、示例和最佳实践,代理不用现场翻 API 文档,直接按验证过的路径干活,省掉几天的研究和联调时间。
| 领域 | 典型能力 |
|---|---|
| 🧬 生物信息与基因组学 | 序列分析、单细胞RNA-seq、基因调控网络、变异注释 |
| 🧪 化学信息与药物发现 | 分子性质预测、虚拟筛选、ADMET、分子对接 |
| 🔬 蛋白质组与质谱 | LC-MS/MS处理、肽段鉴定、蛋白定量 |
| 🏥 临床研究 | 临床试验、药物基因组学、PK/PD建模与剂量评估 |
| 🤖 机器学习 | 深度学习、强化学习、时间序列、贝叶斯方法 |
| 🌍 地理空间科学 | 空间分析、遥感数据、地学工作流 |
技能的 Python 依赖统一用 uv 管理:
# macOS / Linux
curl -LsSf https://astral.sh/uv/install.sh | sh
# Windows
powershell -ExecutionPolicy ByPass -c "irm https://astral.sh/uv/install.ps1 | iex"
# 或 pip
pip install uv
uv --version # 验证
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
# 交互式浏览安装
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills
# 只装单个技能
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills scanpy
# 指定代理宿主
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills --agent cursor
# 固定版本保证可复现
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills --pin v2.64.0
# 用户级
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git ~/.agents/skills/scientific-agent-skills
# 项目级
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git .agents/skills/scientific-agent-skills
技能能执行任意代码、装包、联网、改文件。官方建议:别一次全装,只装你工作需要的子集;装前读一遍 SKILL.md,看它要什么权限、连什么外部服务。
第三方技能可以先本地扫一遍再装:
uv pip install cisco-ai-skill-scanner
skill-scanner scan /path/to/skill --use-behavioral
装好后直接在对话里下达科研指令,例如药物发现管线:让代理检索靶点文献 → 跑虚拟筛选 → 做 ADMET 预测 → 输出候选分子报告,全程单提示词驱动。桌面端还有官方开源的 K-Dense BYOK:自带 API Key,40+ 模型可选,100+ 科学数据库直连,数据不出本机。
全自动科研的另一个代表项目对比看AI-Scientist-v2全自动科研教程,技能体系的模块化组织方式详解看Agent技能模块化集合教程。
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